Краудсорсинговые исследования онкологии с помощью grid-сети
Врачи-исследователи и компания IBM обратились к широкой общественности с просьбой поддержать исследовательскую инициативу Smash Childhood Cancer – усилия по поиску перспективных методов лечения детской онкологии. Ученые из Японии, Гонконга и США запустили краудсорсинговые исследования, цель которых – найти потенциальные лекарственные препараты, которые способны повлиять на ключевые молекулы и белки, контролирующие процессы в раковых клетках в некоторых наиболее распространенных видах онкологических заболеваний у детей. Однако поиск таких препаратов – это, как правило, дорогостоящий и долгий процесс.
Для ускорения и расширения исследований IBM предоставила ученым бесплатный доступ к World Community Grid. Это финансируемая и возглавляемая IBM программа для поддержки научных исследований, которая предусматривает использование вычислительной мощности компьютеров волонтеров по всему миру. Такой ресурс эквивалентен виртуальному суперкомпьютеру, позволяющему быстрее проводить миллионы виртуальных опытов, нацеленных на выявление потенциальных лекарственных препаратов для их дальнейшего изучения.
Волонтеры, желающие поддержать эти исследования, могут участвовать в проекте World Community Grid, скачав и установив бесплатные приложения на свой компьютер или устройства на базе Android. В отсутствие пользовательской нагрузки устройства волонтеров в автоматическом режиме проводят вычисления в рамках виртуальных научных экспериментов исследовательской команды. Результаты впоследствии передаются ученым для дальнейшего анализа.
Глобальная инициатива Smash Childhood Cancer объединяет международную команду экспертов и исследователей из Университета Чиба и Киотского университета в Японии, университета Гонконга, а также Детского медицинского центра Коннектикута, Лаборатории Джексона и Медицинского центра Университета Коннектикута в США. Исследования расширяют поиск медикаментов для лечения нейробластомы и других форм детских онкологических заболеваний, включая опухоль головного мозга, опухоль Вильмса (нефробластома), герминогенные опухоли (влияют на репродуктивную и центральную нервную систему), гепатобластому (рак печени) и остеогенную саркому (рак костей).
Ресурс World Community Grid, предназначенный для ускорения научных открытий, функционирует на базе Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC), программной платформы с открытым исходным кодом, которая была разработана в Калифорнийском университете в Беркли. Частично ресурс размещен в облаке IBM. С 2004 г. инициатива IBM World Community Grid обеспечила поддержку 27 исследовательских проектов, нацеленных на решение важнейших глобальных проблем, таких как борьба с раком, ВИЧ/СПИД, противостояние распространению вирусов Зика и Эбола, изучение генетического картирования, энергоэффективное использование топливных ресурсов, обеспечение чистой водой и охрана природных экосистем.